有极少数的病例报道发生在家族性息肉病（FAP）的背景中，但尚无证据表明与已知的临床及遗传综合症相关。其组织起源和发病机制尚无定论，WHO虽然将其列为胰腺外分泌肿物的上皮性肿瘤，但免疫组化结果提示其具有外分泌、内分泌及少许上皮组织特征。推测来源于胰腺多向分化潜能干细胞或多能胚胎干细胞^【5】。

KRAS，CDKN2A/p16,TP53及SMAD4/DPC4这些在胰腺导管癌中常见的分子改变在SPN中未发现，研究表明SPN与胰腺导管腺癌、胰腺神经内分泌肿瘤（PanNET）具有不同的基因表达谱，主要的分子改变集中在Wnt/β-catenin和Notch信号通路。

多数学者认可β-catenin突变在SPN的发生、发展中起到关键作用。约90%的SPN都有编码β-catenin的CTNNB1基因的第3号外显子点突变，上调的基因激活Wnt/β-catenin、Notch、Hedgehog信号通路，参与肿瘤的形成及发展，同时向神经嵴方向转化^【6】。