整个网络中的拓扑性质来筛选关键的基因
更新日期:2021-08-03     浏览次数:112
核心提示:1.2.6蛋白互做网络分析STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes) 是EMBL开发的蛋白质互作数据库,该数据库从最有力的实验验证导

1.2.6蛋白互做网络分析

STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes) 是EMBL开发的蛋白质互作数据库,该数据库从最有力的实验验证导数据的挖掘、同源预测的蛋白质互作关系都有收录。

对蛋白质相互作用及其网络的了解不仅有助于深入理解生命活动的本质和疾病发生的机制,而且可以为药物研发提供可能的靶点。因此,利用生物信息学的手段研究蛋白质相互作用网络显示出巨大的优势,包括蛋白质相互作等 用网络的绘制与显示、网络的拓扑结构分析、网络的拓扑结构分析、网络结构模块的研究等。我们将差异表达基因映射到相应的蛋白互做网络中,提取子网并对其可视化,并根据基因在整个网络中的拓扑性质来筛选关键的基因。

2022-05-20• KEGG通路分析主要富集在细胞因子受体相互作用
最新的研究成果,本论文的主要观点为目的:利用转录组测序分析挖掘与舌鳞状细胞癌(TSCC)发展相关的关键基因,旨在筛选TSCC的候选生物标志物,同时分...
2021-07-06• 鲸类低氧耐受的分子机制初探:基于HIF1α和TSC1
摘要鲸类(Cetacea)具有超强潜水能力,长时间潜水造成的体内低氧是其适应完全水生生活面临的挑战之一。为了克服体内低氧环境,鲸类产生了一系列低氧耐受...
2021-07-06• 鲸类低氧耐受的分子机制初探:基于HIF1α和TSC1
摘要鲸类(Cetacea)具有超强潜水能力,长时间潜水造成的体内低氧是其适应完全水生生活面临的挑战之一。为了克服体内低氧环境,鲸类产生了一系列低氧耐受...
2021-06-09• 介导基因组中遥远序列之间的相互作用,使染色质
三维交互基因可以通过染色质环在空间上进行相互作用。研究表明染色质可形成环状结构,使线性距离较远的基因座可以在空间上密切接近[13, 14],而这种空...
2021-05-24• RPL35A基因在不同月龄寒泊羊肌肉组织中的表达及
摘要本实验旨在探究核糖体蛋白基因(RPL35A)在不同月龄寒泊羊肌肉组织中的mRNA表达及其生物学功能。选取1月龄、7月龄和13月龄寒泊公羊各3只,采集背最长...
2021-01-08• 生物信息学分析成牙骨质细胞矿化过程中可变剪接
最新的研究成果,本论文的主要观点为目的:生物信息学分析成牙骨质细胞矿化过程中可变剪接事件以及差异可变剪接基因富集到的生物学功能和信号通路。方...
2020-08-28• 阵发性房颤基因表达谱的生物信息学分析
《阵发性房颤基因表达谱的生物信息学分析》为作者:张宏伟最新的研究成果,本论文的主要观点为。不知是否符合录用要求,望您批评与指正。...
2020-08-27• 解淀粉芽孢杆菌YP6中碱性磷酸酯酶AP2的生物信息
《解淀粉芽孢杆菌YP6中碱性磷酸酯酶AP2的生物信息学分析及酶学性质研究》为作者:孟迪最新的研究成果,本论文的主要观点为摘要:以解淀粉芽孢杆菌YP6...