2.3  SSU rRNA基因部分序列测定及其进化树分析

测序结果表明，芽囊原虫的SSU rRNA基因序列长度为1100 bp，使用DNAstar SeqMan将DNA峰图进行比对，登录NCBI经BLAST比对结果显示，4份样品比对结果显示为人芽囊原虫，其序列与人芽囊原虫（Blastocystis hominis）相似度高达99.61%。DNA star软件MegAlign程序分析12份样品的同源性为96.19%～100.0%。

利用MEGA6.0软件，用相邻法构建进化树。比较结果表明，本研究获得的12个芽囊原虫阳性分离株处于2个不同的分支。其中，2份属于ST8型，其余10份显示与登录号为KR262930的人芽囊原虫的序列相聚在同一小分支内，并与ST1亚型合并为同一条分支。表明芽囊原虫ST1亚型在灵长类动物中感染普遍，这与目前文献报道的ST1型为灵长类的优势亚型一致。