蛋白的A结构域识别
更新日期:2022-07-12     浏览次数:81
核心提示:2.SWN基因簇各基因的功能swnK编码一个PKS-NRPS杂合酶,是多功能蛋白,与一般微生物的PKS-NRPS不同的是,其PKS和NRPS模块发生颠倒,即NRPS-PKS。swnK包

2.SWN基因簇各基因的功能

swnK编码一个PKS-NRPS杂合酶,是多功能蛋白,与一般微生物的PKS-NRPS不同的是,其PKS和NRPS模块发生颠倒,即NRPS-PKS。swnK包括几个结构域:氨基酸腺苷化结构域(A)、β-酮酰基合成酶结构域(KS)、酰基转移酶结构域(AT)、β-酮酰基还原酶结构域(KR)以及两个磷酸乙酯结合/硫代化结构域(T和ACP)。罗飞飞等(罗飞飞,2020)推测绿僵菌中swnK各结构域顺序是A-T-KS-AT-KR-ACP-R,推测其编码的多功能蛋白SwnK的作用过程为:首先哌啶酸(L-PA)作为起始底物被蛋白的A结构域识别,随后KS结构域接受上游肽酰链,与下游丙二酰CoA缩合,形成C-C键,为产物增加两个碳原子,KR结构域能够将酮基还原成羟基,最后由末端R结构域将醛基与氨基环化并脱水生成亚胺离子。Cook等人(Cook 2016)及罗飞飞等(罗飞飞,2020)先后在绿僵菌中敲除SWN基因簇的swnK基因,敲除株中均没有检测到苦马豆素,Cook(Cook 2016)等在swnK基因功能互补株中检测到SW,推测该酶在绿僵菌的SW合成途径中以哌啶酸为底物,催化生成1-酮基吲哚里西啶。