每条边代表各作用靶点之间的相互作用关系
更新日期:2022-08-04     浏览次数:111
核心提示:三、护卵汤治疗多囊卵巢综合征作用靶点分析将护卵汤治疗多囊卵巢综合征的潜在作用靶点载入到 STRING 数据库以求获得蛋白的相互作用的关系,采用Cytosc

三、护卵汤治疗多囊卵巢综合征作用靶点分析

将护卵汤治疗多囊卵巢综合征的潜在作用靶点载入到 STRING 数据库以求获得蛋白的相互作用的关系,采用Cytoscape(Version 3.7.2)软件中的构建的靶点蛋白相互作用的网络,如图1-2所示。图中149个节点(nodes),586条边(edges)。各个节点是作用靶点,每条边代表各作用靶点之间的相互作用关系。PPI结果显示PIK3R1、STAT3、JUN、VEGFA和F2等靶点的中心度值均高于均值,其中,JUN 在多囊卵巢综合征中的高表达可能与 PCOS 发病机制存在一定关系,VEGF-A表达下调可能是PCOS子宫内膜增生过度的一种代偿性作用。因此,JUN和VEGFA被认为是可能的关键靶点。

2022-09-02• 生脉散合血府逐瘀汤与心力衰竭
2. 2 心力衰竭疾病靶点筛选通过在TTD,CTD,OMIM和GeneCards数据库检索,并结合相关文献,限定Score10,共得到与心力衰竭疾病相关人类靶点1132个。2.3...
2022-06-01• 促进网络药理学的发展和广泛应用
1.网络药理学的溯源及发展随着生物信息学、系统生物学等跨学科领域的兴起,国内外学者开始了基于网络的生物医学研究。2007年国内学者李彦宏发表《网络...
2022-05-19• 对体内睾酮水平的调节
2.4 蛋白互作(PPI)网络的构建与核心靶点的筛选使用STRING平台构建PPI网络图。使用Cytoscape软件以及插件CytoNCA,按照degree排序,在交集靶点基础上...
2022-04-08• 补肺益肾方中活性成分与核心靶点间的结合性能
2.2 药物-活性成分-靶点网络构建将筛选出的药物成分及靶点信息导入Cytoscape 3.9.1软件构建补肺益肾方治疗COPD的药物-活性成分-靶点网络图,见图1,共...
2022-04-08• 蓝色代表药物活性成分
2.2 药物-活性成分-靶点网络构建将筛选出的药物成分及靶点信息导入Cytoscape 3.9.1软件构建补肺益肾方治疗COPD的药物-活性成分-靶点网络图,共包括699...
2022-01-20• 节点的 degree 值对节点进行大小和颜色的标注
2.2 健脾化痰方化合物-靶点网络构建及相互作用分析 利用 Cytoscape3.6.1 软件将 267 个化合物与对应靶点构建化合物⁃靶点网络,经 删除重复靶点,共取...
2021-11-24• 在 STRING 数据库中进行交集基因的蛋白互作网络
1.3药物-疾病交集靶点基因、蛋白构建 使用在线 Venny 平 台 ,将川芎-石菖蒲 药对靶点基因与 VCI 疾病靶点取交集,并绘制共同基因的韦恩图。在 STRING...
2021-11-12• 目标靶点为高脂血症的潜在靶点
2.2高脂血症疾病靶点数据库在Genecards数据库中,初步筛选获得1463个与高脂血相关的候选基因。根据Relevance score值,结合经验设置score值大于中位数...
2021-11-11• 蛋白质的相互作用分析
4中药牛蒡子治疗糖尿病肾病核心靶点蛋白质互作网络的构建蛋白质互作网络是完成生物信号传递、基因表达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程...
2021-08-10• RNA聚合酶Ⅱ启动子对转录的正向调控
2.3.1 GO分析结果将五味子作用于肾损伤的319个共同靶基因进行GO分析,输出结果共分为三部分内容,包括BP,CC,MF三个部分。BP分析显示五味子改善肾损...