MiSeq 测序平台测定麋鹿粪便菌群多样性
更新日期:2020-01-14     来源:中国畜牧杂志   作者:李俊芳  浏览次数:3
核心提示:《MiSeq 测序平台测定麋鹿粪便菌群多样性》为作者:李俊芳最新的研究成果,本论文的主要观点为本研究以麋鹿为研究对象,对其粪便中的细菌多样性进行分

《MiSeq 测序平台测定麋鹿粪便菌群多样性》为作者:李俊芳最新的研究成果,本论文的主要观点为本研究以麋鹿为研究对象,对其粪便中的细菌多样性进行分析。采集北京麋鹿生态实验中心、河北木兰围场、辽宁千山鹿场和湖北石首麋鹿国家级自然保护区粪便样本共32份,提取粪便微生物DNA,应用miseq平台进行测序。本研究共得到1,438,677条序列,每个样品平均44,959±12,153条序列。以97%的序列相似性为标准,共得到31,459个物种分类的OTUs(Operational Taxonomic Units),每个样品平均有983±240个OTUs。在门的水平上,麋鹿粪便细菌由11个门组成,主要包括厚壁菌门(45。12%)、拟杆菌门(33。27%)、变形菌门(3。49%)、螺旋体门(2。98%)。其中,厚壁菌门和拟杆菌门为优势菌群。Alpha多样性物种指数范围区间较大,香农指数的范围为3。42~4。72,辛普森指数的范围为0。01~0。22,表明不同麋鹿的细菌多样性存在差异。本研究表明后壁菌门和拟杆菌门是麋鹿消化道优势细菌。不知是否符合录用要求,望您批评与指正。

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