镉胁迫下马铃薯转录组基因的挖掘及生物学分析
更新日期:2020-07-24     来源:种子   作者:郭超  浏览次数:122
核心提示:《镉胁迫下马铃薯转录组基因的挖掘及生物学分析》为作者:郭超最新的研究成果,本论文的主要观点为为研究马铃薯响应镉胁迫过程中相关基因的表达分子机

《镉胁迫下马铃薯转录组基因的挖掘及生物学分析》为作者:郭超最新的研究成果,本论文的主要观点为为研究马铃薯响应镉胁迫过程中相关基因的表达分子机制,本研究以材料“云薯801”马铃薯进行短期和长期镉胁迫试验,使用第二代高通量测序技术检测镉胁迫下马铃薯发棵期叶片中的差异表达基因,通过Mapman透视差异基因分布,并对差异基因进行WEGO和KEGG富集分析,结果表明:在短期和长期镉胁迫中共发现了450/3066个差异表达基因,对获得的差异表达基因进行注释和归类,筛选出92个在马铃薯在镉胁迫下差异表达的相关功能基因。差异基因主要集中表现在光合系统、激素系统、氧化还原系统及其他系统,光合系统中控制光反应和光呼吸的基因表达量略有上升,调节脱落酸(ABA)合成与物质代谢的基因表达量发生明显下调,控制赤霉素(GA)合成的基因表达量过表达与下调均有表现且变化幅度较大, 控制类苯基脂以及酚醛合成的基因表达量明显上升。在短期胁迫组中,共有450个差异表达基因被分配到1291个GO功能注释项,其中230个过表达基因分配到966个GO功能注释项,220个下调基因被分配到872个GO功能注释项。在长期镉胁迫下,有3066个差异表达基因被分配到2894个GO注释项中,其中1572个过表达基因分配到2356个GO注释项,1494个下调基因分配到2240个GO注释项。在长期外界镉胁迫下马铃薯植株内新陈代谢过程、光合作用、叶绿素合成代谢、DNA复制、碳代谢、氨基酸合成、内质网蛋白合成、谷氨酸代谢等途径均受到镉胁迫的影响并且相关控制基因在表达量上都出现差

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