蛋白中提取有意义的生物学信息
更新日期:2022-01-06     浏览次数:90
核心提示:2.5. GO富集分析和KEGG通路分析DAVID数据库(The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery)是集分析和整合的数据库,基于

2.5. GO富集分析和KEGG通路分析

DAVID数据库(The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery)是集分析和整合的数据库,基于大量的基因、蛋白中提取有意义的生物学信息[13]。将药物-疾病交集基因上传至DAVID数据库,基因标识符选择OFFICIAL_GENE_SYMBOL,物种设置为“Homo Sapiens”。利用DAVID6.8 GO基因功能从生物过程(Biological Process,BP)、细胞成分(Cellular Component,CC)、分子功能(Molecular Function,MF)三方面注释PN治疗肠易激综合征的作用靶蛋白在基因功能中的作用。为阐明PN治疗肠易激综合征在信号通路中进行KEGG通路富集分析。选取GO功能条目和KEGG通路条目(P<0.05)作为PN治疗肠易激综合征的主要基因功能富集过程和信号通路,预测PN治疗肠易激综合征的作用机制。