构建蛋白质相互作用的网络图
更新日期:2022-03-08     浏览次数:106
核心提示:1.6 新处方与骨折不愈合的交集靶点获取及靶点基因相互作用网络(PPI)构建 将筛选出的新处方靶点基因与骨折不愈合靶点基因,导入R语言(Version R x6

1.6 新处方与骨折不愈合的交集靶点获取及靶点基因相互作用网络(PPI)构建 将筛选出的新处方靶点基因与骨折不愈合靶点基因,导入R语言(Version R x64 4.1),运行脚本后获得两者靶点基因的重叠交集并绘制Venn图,此交集部分则为新处方治疗骨折不愈合的靶点基因,随后将其导入STRING数据库,设置物种为人类(Homo spaiens),可信度为中等可信度(medium confidence),隐藏未连接的节点后得到蛋白质相互作用网络的结果,再将其导入Cytoscape 3.7.2,构建蛋白质相互作用的网络图,并得出每一个靶点基因与其他基因相互之间连线的数目,此文将其称为基因连接数,随后利用EXCLE作图功能,制作新处方-疾病核心靶标条形图。

 

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