设计特异的引物和探针
更新日期:2022-03-16     浏览次数:93
核心提示:1.1.1五种菌株标准质粒的构建以各菌种基因组DNA作为模板,进行PCR获得各菌种特异性目的片段,引物序列如表2所示。PCR体系包括:2HiFi PCR SuperMix(

1.1.1 五种菌株标准质粒的构建 

以各菌种基因组DNA作为模板,进行PCR获得各菌种特异性目的片段,引物序列如表2所示。PCR体系包括:2×HiFi PCR SuperMix(含Taq 酶和dNTP)25 µL,上下游引物 (10mM)各1µL,ddH2O 补至50 µL。PCR 反应条件为95 ℃变性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸30s,反应30个循环;反应前95 ℃预变性5 min;反应结束72 ℃保持10 min。PCR产物用1%琼脂糖凝胶电泳检测。检测结束,使用凝胶回收试剂盒切胶回收PCR产物。

胶回收产物连接至TOPO载体。连接体系如下:胶回收产物2 µL,M5 Hiper pToPo-TA vector 1 µL,10×Enhancer 1 µL,ddH2O 补齐至10 µL。混匀,50 ℃连接 15-30 min。

连接产物转化至感受态细胞DH5α中,步骤如下:(1)取50 µL冰浴融化的感受态细胞,加入5 µL目的DNA,混匀,冰浴放置30 min;(2) 42 ℃水浴热激45 s,然后快速置于冰浴2 min;(3)向每个离心管中加入500 µL不含抗生素的LB培养基,混匀后置于摇床37 ℃,200 rpm振荡培养1 h,使细菌复苏;(4)取出200 µL培养基涂布于含有氨苄的平板上至液体被吸收,37 ℃倒置培养过夜。