分析蛋 白质参与的生物学进程描述蛋白质功能
更新日期:2022-04-14     浏览次数:91
核心提示:1.3 荷叶活性成分-高脂血症靶点 PPI 网络构建 为明确荷叶活性成分靶点和高脂血症靶点之间的相互作用,通过 R 语言筛选出荷叶活性 成分靶点和高脂血症

1.3 荷叶活性成分-高脂血症靶点 PPI 网络构建
为明确荷叶活性成分靶点和高脂血症靶点之间的相互作用,通过 R 语言筛选出荷叶活性
成分靶点和高脂血症靶点的共同靶点并绘制 Venn 图,提交共同靶点至 String 数据库构建
PPI 网络模型,设定物种为“homo sapiens”且最小相互作用阈值“highest confidence(>
0.9)”,通过 Cytoscape3.7.1 进一步分析得到的 PPI 网络,得到蛋白质功能并通过分析蛋
白质参与的生物学进程描述蛋白质功能。
1.4 荷叶活性成分-高脂血症靶点和通路富集分析
提交荷叶调节高脂血症的靶点至 metascape 软件,设定 P 范围,分析其主要的生物学过
程与代谢通路进行富集分析,保存数据结果且可视化分析数据。

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