一、分子模拟及分子图像技术简介

分子模拟（Molecular Simulation）¹是二十世纪初发展起来的一种计算机模拟方法，用于在原子或分子水平上研究大分子的物理和化学性质。分子模拟根据分子的物理和化学的基本原理构建数学模型，采用高性能计算机进行运算，获取分子的物理和化学信息，用以代替实验测量的研究方法。其应用范围覆盖了生物生物医学、物理、化学、化工及材料等学科领域，多数能够得到与实验结果近似的计算结果，己经成为与实验技术并重的强有力的研究手段。由于模拟结果随着计算机的发展与模拟方法（算法）的改良而更加精确，分子模拟已成为包括生物医学在内的众多领域中不可缺少的工具。分子模拟理论和技术的奠基人之一、1966年诺贝尔化学奖获得者——Robert Sanderson在获奖时的感言是：“总之，我愿意强调我的信念：计算化学的年代已经到来，成千上百的化学家以计算机代替实验室，来获得众多的化学信息。”