档案库房是保存档案最基本的物质条件，是档案保护技术中长期起作用的因素。^[9]档案库房的选址是一个非常重要的环节，它为档案保护提供了一个较为稳定的外部环境，影响档案的长期保存。

黄册库的选址关系到有关国家治理的重要资料的保存和安全。黄册库位于南京后湖，明朝向北迁都之后也未改变位置，可见明朝皇帝选择后湖作为黄册库的地址是深思熟虑的决定。后湖作为黄册库选址在历史上经历了较为坎坷的命运。”晋宋相承，迄于五季，皆为练兵、游乐之所，而宋元又废之以为田”^[10]。直至明代，后湖才成为收藏户籍档案的场所。

明代档案以纸质档案为主，大量户籍档案集中存储使得防火成为第一要务。后湖位于南京城北，太平门外，周回四十里，周围群山环绕，并且在其群山的西北，就是长江，^[11]地理位置优越。黄册就存放于湖中心五个洲，主要存放在西北和西南的洲中，西南部分布着水深而澄的黑龙潭，且湖心洲际之间有十字河，极有可能是宋代所开凿的人工河。